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马萨里克大学是捷克最古老、最大的大学之一。直到第一次世界大战结束，奥匈帝国瓦解之后，布尔诺才建立了其第一所大学。1919年1月28日，法律公布拥有四所学院-法学院、医学院、理科学院及文科学院的捷克马萨里克大学在布尔诺建立，以具有卓越贡献的捷克斯洛伐克首位总统Tomáš Garrique Masaryk命名。
马萨里克大学以其高度的知识能量与抱负，很快在许多领域赢得了很高的荣誉。马萨里克大学法学院是该大学的骄傲。“布尔诺的法学院”以标准化法律理论为基础，取得了国际荣誉。马萨里克大学的其它学院也同样充满活力，取得了很大的成功。
1964年教育学院合并入马萨里克大学，1989年11月之后再度繁盛。1990年，经济与行政管理学院成立，随后于1994年建立信息学院，1998年社会研究学院社，并于2001年建立体育研究学院。作为国际合格，大学的研究活动也大大增加，不仅有双边合作(与单个国外大学)还包括Compostela Group of Universities大学集团内的合作。
今天，马萨里克大学是捷克共和国公认的最重要的教育和研究机构，是一所遵循民主传统的、值得尊敬的中欧大学。马萨里克大学也是布尔诺及周边地区主要的社会和文化支柱。
马萨里克大学设有9个学院，共有200多个系、专科学院及讲习所，涵盖了广泛的学科和研究领域。大学的建筑物集中位于布尔诺旧城中心附近。来自捷克共和国、欧洲及世界其他地区-60多个国家的40,000名学生在马萨里克大学学习，使其成为捷克共和国的第二大高等教育机构。马萨里克大学对创新性研究提出了很高的要求，以为大学教育提供尽可能多的适合学生能力的教学方法，满足现代就业市场对学生的要求。(基于2004年所做的调查，马萨里克大学毕业生就业率达98%)。三年学士学位以及两年硕士课程的开设为有志入读马萨里克大学的学生提供了更多的机会，同时最近引入的欧洲学分转移制(ECTS)有助于促进课程在欧洲范围内的国际化，吸引了越来越多的国际学生。
与世界其它大学一样，马萨里克大学融入了当今激烈竞争环境下的信息社会之中。学生驱动教育模式、欧洲学分转移制、网络通信、网上远程教育等方式，在激烈的竞争中依然存在。马萨里克大学信息学院的人员不仅致力于网上远程教育，更着眼于整个信息社会，因其卓越的贡献于2005年得到极高的荣誉和表彰。
研究项目涉及医学、自然科学、社会科学、人类学、经济学和法学，主要成就有：
·发现生化酶的新特性，推动医药品等商业生产
·在南极洲成立捷克第一个极地研究站
·在生理学和病理学条件下，成功对成血干细胞进行研究（通过骨髓移植进行血液再造）
·在心理和社会学上对儿童发展进行研究
·通过电脑操作对细胞进行三维立体分析，研究遗传组织
马萨里克大学投入大量资金，对学校建筑物进行修建和配备现代化设施，另外，正在筹备建造一座容纳5000名学生和500名教职人员的现代化教学与研究综合大楼。
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